Virus hepatitidy C (HCV) je příčinou přibližně 20 % případů akutní hepatitidy, 70 % chronické hepatitidy a 30 % onemocnění jater v konečném stadiu ve Spojených státech. Akutní infekce má inkubační dobu 7 týdnů (rozmezí 4-20 týdnů) a je symptomatická a ikterická pouze u třetiny pacientů. Hladiny sérových aminotransferáz se obvykle zvyšují více než desetinásobně a s ústupem příznaků a symptomů klesají do normálního rozmezí. Protilátky proti HCV jsou obvykle, ale ne vždy, přítomny v době nástupu příznaků. HCV RNA se objevuje v séru na počátku inkubační doby, zvyšuje titr a dosahuje vrcholu v době příznaků a poté při ustupujícím onemocnění mizí. Důležité je, že u 85 % pacientů s akutní infekcí HCV se vyvine chronická infekce. U těchto pacientů zůstává HCV RNA přítomna a přibližně u dvou třetin pacientů zůstávají aminotransferázy zvýšené v rozmezí 1,5 až 10násobku horní hranice normy. Průběh chronické hepatitidy C je variabilní. Příznaky má pravděpodobně méně než 20 % pacientů a jsou obvykle intermitentní, neurčité a nespecifické, většinou se jedná o malátnost a snadnou unavitelnost. U malého procenta pacientů se vyvinou extrahepatální projevy hepatitidy C, včetně kryoglobulinemie a glomerulonefritidy. Odhaduje se, že u 20-30 % pacientů s chronickou hepatitidou C se vyvine cirhóza, ale tento proces je obvykle pomalý a zákeřný. Jakmile se cirhóza rozvine, příznaky jsou častější a mohou se objevit známky konečného stadia jaterního onemocnění se žloutenkou, slabostí, chřadnutím a krvácením do zažívacího traktu. Pacienti s cirhózou jsou také ohroženi vznikem hepatocelulárního karcinomu. Toto významné jaterní onemocnění má tedy proteinové projevy, ale je často zákeřné a může vést ke konečnému stadiu jaterního onemocnění navzdory přítomnosti několika příznaků a známek nemoci.