Trypsin štěpí specificky peptidové vazby na C-konci lysinových a argininových zbytků, s výjimkou vazeb -Arg-Pro- a -Lys-Pro-, které jsou normálně odolné vůči proteolýze. Zde uvádíme důkaz o tryptickém štěpení -Lys-Pro- u modifikovaných derivátů oligotuftsinu, Ac-4-NH2) (1), s použitím hmotnostní spektrometrie s vysokým rozlišením a HPLC jako základních metod pro analýzu proteolytických reakcí. Proteolytická náchylnost vazeb -Lys-Pro- byla silně závislá na doprovodných zbytcích a předpokladem tohoto neobvyklého štěpení může být flexibilita peptidové páteře. Zatímco vazby -Lys-Gly- v 1 byly rychle štěpeny, modifikace těchto Lys zbytků připojením epitopu ß-amyloidu(4-10) za vzniku derivátů -Lys(X)-Gly zabránila štěpení této vazby a zajistila trypsinové štěpení vazeb -Lys-Pro-, přičemž cesta této degradace byla nezávislá na typu řetězců na straně Lys-Nε (acetylové skupiny, aminokyseliny, peptidu). Náhrada zbytků Lys za Ala v polohách P′2 snížila tryptické štěpení, zatímco náhrada objemného postranního řetězce Thr v polohách P2 silně zvýšila štěpení vazeb -Lys-Pro-. Údaje o cirkulárním dichroismu (CD) modifikovaných oligotuftsinových derivátů jsou v souladu se zvýšenou flexibilitou peptidové páteře, která je předpokladem zvýšené náchylnosti ke štěpení vazeb -Lys-Pro-. Tyto výsledky získané u oligotuftsinových derivátů mohou mít význam pro proteolytickou degradaci cílových peptidů, které vyžadují specifické konformační předpoklady. Copyright © 2007 European Peptide Society and John Wiley & Sons, Ltd.
.