Alai

La trypsine clive spécifiquement les liaisons peptidiques du côté C-terminal des résidus lysine et arginine, sauf pour les liaisons -Arg-Pro- et -Lys-Pro- qui sont normalement résistantes à la protéolyse. Nous rapportons ici la preuve d’un clivage tryptique -Lys-Pro- dans les dérivés modifiés de l’oligotuftsine, Ac-4-NH2) (1), en utilisant la spectrométrie de masse à haute résolution et la CLHP comme méthodes principales d’analyse des réactions protéolytiques. La susceptibilité protéolytique des liaisons -Lys-Pro- dépendait fortement des résidus flanquants, et la flexibilité du squelette peptidique pourrait être une condition préalable à ce clivage inhabituel. Alors que les liaisons -Lys-Gly- dans 1 étaient rapidement clivées, la modification de ces résidus Lys par la fixation d’un épitope ß-amyloïde (4-10) pour donner des dérivés -Lys(X)-Gly a empêché le clivage de cette liaison, et a permis le clivage par la trypsine des liaisons -Lys-Pro-, la voie de cette dégradation étant indépendante du type de chaînes latérales Lys-Nε (groupe acétyle, acide aminé, peptide). La substitution des résidus Lys par Ala aux positions P′2 a diminué le clivage tryptique, tandis que le remplacement de la chaîne latérale volumineuse de Thr aux positions P2 a fortement augmenté le clivage des liaisons -Lys-Pro-. Les données de dichroïsme circulaire (CD) des dérivés modifiés de l’oligotuftsine sont en accord avec une flexibilité accrue du squelette peptidique, comme condition préalable à une susceptibilité accrue au clivage des liaisons -Lys-Pro-. Ces résultats obtenus sur les dérivés de l’oligotuftsine pourraient avoir des implications dans la dégradation protéolytique des peptides cibles qui nécessitent des conditions préalables de conformation spécifiques. Copyright © 2007 European Peptide Society et John Wiley & Sons, Ltd.