L’ubiquitine est une petite protéine régulatrice (8,6 kDa) et l’ubiquitination est une modification post-traductionnelle importante, dans laquelle les ubiquitines sont attachées à une protéine substrat. Ce processus contient trois étapes principales : l’activation, la conjugaison et la ligation et nécessite trois types d’enzymes : les enzymes activatrices d’ubiquitine (E1s), les enzymes conjugatrices d’ubiquitine (E2s) et les ubiquitine ligases (E3s).
Figure 1. Le système ubiquitine-protéasome (Suresh B, et al., 2016).
Le système ubiquitine-protéasome assure la médiation de 80 % à 85 % de la dégradation des protéines chez les eucaryotes. En plus de participer à la dégradation des protéines, l’ubiquitination est impliquée dans presque toutes les activités de la vie, y compris la régulation du cycle cellulaire, la prolifération, l’apoptose, la différenciation, la régulation transcriptionnelle, l’expression génique, la régulation transcriptionnelle, la transmission du signal, la réparation des dommages, l’immunité inflammatoire. L’ubiquitination est liée à la pathogenèse de maladies, telles que le cancer et les maladies cardiovasculaires. Par conséquent, il est devenu une nouvelle cible pour la recherche et le développement de nouveaux médicaments.
Vue d’ensemble de l’analyse de l’ubiquitination des protéines
Creative Proteomics a déjà développé une plate-forme professionnelle pour les services d’analyse de l’ubiquitine-protéomique pour vous aider à résoudre les problèmes de recherche de l’identification et de la quantification de l’ubiquitination. Grâce à des services complets d’analyse de l’ubiquitination des protéines, y compris l’extraction des protéines, la digestion, l’enrichissement des peptides, l’analyse LC-MS/MS, l’analyse des données et l’analyse bioinformatique, nous pouvons analyser rapidement, précisément et efficacement les changements de diverses modifications des protéines liées à la maladie pour répondre aux besoins de l’identification des biomarqueurs et du dépistage des cibles médicamenteuses.
Figure 2. Le flux de travail de l’analyse de l’ubiquitination des protéines.
Exigences relatives aux échantillons
Nous pouvons accepter une variété d’échantillons, y compris, mais sans s’y limiter :
- Tissus végétaux : racines, xylème, phloème, etc.
- Tissus animaux
- Microorganismes
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Fluides corporels : salive, liquide amniotique, liquide céphalo-rachidien, sérum, urine, etc.
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Extrait de protéines. Afin de garantir les résultats du test, veuillez informer les composants du tampon, s’il contient de la thiourée, du SDS ou des sels ioniques forts. En outre, l’échantillon ne doit pas contenir de composants tels que des acides nucléiques, des lipides et des polysaccharides, qui affecteront l’effet de séparation.
Si vous voulez connaître les exigences spécifiques des échantillons, n’hésitez pas à nous contacter.
Livraison
- Rapport détaillé, y compris les procédures d’expérience, les paramètres, etc.
- Données brutes et résultats d’analyse des données (identifications de protéines et cartographie de l’ubiquitine)
Nos avantages
- Haut débit : identifier et quantifier jusqu’à des milliers de protéines à la fois
- Haute précision et exactitude : identification précise des peptides modifiés et des sites de modification
- Couverture à 100 % : Utilisation de 2 à 3 enzymes pour la digestion des protéines afin d’assurer une couverture complète
- Capacité d’analyser les ubiquitine-protéines de faible abondance
- Installations de pointe : Triple TOF 5600, Q-Exactive, Orbitrap Fusion Tribrid
À Creative Proteomics, de nombreux experts excellents et expérimentés optimiseront le protocole expérimental en fonction de votre exigence et garantiront les résultats de haute qualité pour l’ubiquitination des protéines. Creative Proteomics fournit une large gamme de technologies pour la recherche sur l’ubiquitine qui permettent de quantifier la quantité de protéines et la modification de l’ubiquitination. N’hésitez pas à nous contacter pour discuter de vos besoins spécifiques.