Ubiquitin er et lille (8,6 kDa) regulerende protein, og ubiquitinering er en vigtig posttranslationel modifikation, hvor ubiquitiner er knyttet til et substratprotein. Denne proces indeholder tre hovedtrin: aktivering, konjugering og ligering og kræver tre typer enzymer: ubiquitin-aktiverende enzymer (E1’er), ubiquitin-konjugerende enzymer (E2’er) og ubiquitinligaser (E3’er).
Figur 1. Ubiquitinproteasomsystemet (Suresh B, et al., 2016).
Ubiquitin-proteasomsystemet medierer 80-85 % proteinnedbrydning i eukaryoter. Ud over at deltage i proteinnedbrydning er ubiquitinering involveret i næsten alle livsaktiviteter, herunder cellecyklusregulering, proliferation, apoptose, differentiering, transkriptionel regulering, genekspression, transkriptionel regulering, signaloverførsel, skadesreparation, inflammatorisk immunitet. Ubiquitination er forbundet med sygdomsfremkaldelse, f.eks. kræft og hjerte-kar-sygdomme. Derfor er det blevet et nyt mål for forskning og udvikling af nye lægemidler.
Oversigt over analyse af ubiquitination af proteiner
Creative Proteomics har allerede udviklet en professionel platform for ubiquitin-proteomics-analysetjenester for at hjælpe dig med at løse forskningsproblemer med ubiquitinationsidentifikation og -kvantificering. Gennem omfattende protein ubiquitinationsanalysetjenester, herunder proteinekstraktion, fordøjelse, peptidberigelse, LC-MS/MS-analyse, dataanalyse og bioinformatikanalyse, kan vi hurtigt, præcist og effektivt analysere ændringerne af forskellige sygdomsrelaterede proteinmodifikationer for at opfylde behovene for biomarkøridentifikation og screening af lægemiddelmål.
Figur 2. Arbejdsgangen for ubiquitineringsanalyse af proteiner.
Prøvekrav
Vi kan acceptere en række forskellige prøver, herunder, men ikke begrænset til:
- Plantevæv: rødder, xylem, phloem osv.
- Dyrevæv
- Mikroorganismer
-
Kropsvæsker: spyt, fostervand, cerebrospinalvæske, serum, urin osv.
-
Proteinekstrakt. For at sikre testresultaterne bedes du oplyse bufferkomponenterne, om de indeholder thiourea, SDS eller stærke ion-salte. Desuden bør prøven ikke indeholde komponenter som nukleinsyrer, lipider og polysaccharider, som vil påvirke separationseffekten.
Hvis du ønsker at kende specifikke krav til prøver, er du velkommen til at kontakte os.
Levering
- Detaljeretaljeret rapport, herunder forsøgsprocedurer, parametre osv.
- Rå data og dataanalyseresultater (proteinidentifikationer og ubiquitinkortlægning)
Vores fordele
- Højt gennemløb: identificer og kvantificer op til tusindvis af proteiner på én gang
- Høj præcision og nøjagtighed: nøjagtig identifikation af modificerede peptider og modifikationssteder
- 100% dækning: Brug 2-3 enzymer til proteindøjning for at sikre fuld dækning
- Mulighed for at analysere ubiquitin-proteiner med lav abundans
- Stopmoderne faciliteter: Hos Creative Proteomics vil mange fremragende og erfarne eksperter optimere den eksperimentelle protokol i henhold til dine krav og garantere resultater af høj kvalitet for ubiquitinering af proteiner. Creative Proteomics tilbyder en bred vifte af teknologier til ubiquitinforskning, der muliggør kvantificering af proteinmængde og ubiquitinationsmodifikation. Du er velkommen til at kontakte os for at drøfte dine specifikke behov.