I dag er Bosnien-Hercegovina en stat, der består af to enheder – Føderationen Bosnien-Hercegovina (FB&H) og Republikken Srpska (RS), og et distrikt – Brcko-distriktet. Enhederne har betydelige beføjelser og ansvar for deres udvikling. På Bosnien-Hercegovinas niveau, dvs. på statsligt niveau, er der ministerrådet med seks ministerier samt et par statslige ekspertinstitutioner som f.eks. agenturet for statistik, instituttet for standardisering, målinger og patenter, agenturet for telekommunikation osv.
På miljøområdet har Bosnien-Hercegovinas ministerium for udenrigshandel og økonomiske forbindelser (MOFTER) ansvaret for koordinering af aktiviteter og internationale forbindelser.
Siden Dayton-fredsaftalen har miljøspørgsmål i B&H været under entitetsregeringernes ansvarsområde. De tilsvarende myndigheder er Miljø- og Turismeministeriet i Føderationen Bosnien-Hercegovina, Ministeriet for fysisk planlægning, civilingeniørarbejde og økologi i Republikken Srpska og Departementet for forsyningstjenester i Brcko-distriktet. Arbejdet i både enhedsministerierne og Brcko-distriktets afdeling er reguleret af en række miljølove.