Alai

Trypsin spalter specifikt peptidbindinger på den C-terminale side af lysin- og arginininrester, med undtagelse af -Arg-Pro- og -Lys-Pro- bindinger, som normalt er resistente over for proteolyse. Her rapporterer vi beviser for en -Lys-Pro- tryptisk spaltning i modificerede oligotuftsin-derivater, Ac-4-NH2) (1), ved hjælp af højopløsningsmassespektrometri og HPLC som primære metoder til analyse af proteolytiske reaktioner. Den proteolytiske modtagelighed for -Lys-Pro- bindinger var stærkt afhængig af de flankerende rester, og fleksibiliteten af peptidryggen kan være en forudsætning for denne usædvanlige spaltning. Mens -Lys-Gly- bindinger i 1 blev hurtigt spaltet, forhindrede modifikation af disse Lys-rester ved tilknytning af en ß-amyloid(4-10)-epitop for at give -Lys(X)-Gly-derivater spaltning af denne binding og gav trypsin-spaltning af -Lys-Pro- bindinger, idet denne nedbrydningsvej var uafhængig af typen af Lys-Nε-sidekæder (acetylgruppe, aminosyre, peptid). Substitution af Lys-resterne med Ala i P′2-positionerne mindskede den tryptiske spaltning, mens udskiftning af den voluminøse sidekæde af Thr i P2-positionerne kraftigt øgede spaltningen af -Lys-Pro- bindinger. Cirkulær dichroisme (CD) data for de modificerede oligotuftsin derivater er i overensstemmelse med øget fleksibilitet af peptidryggen, som er en forudsætning for øget modtagelighed for spaltning af -Lys-Pro- bindinger. Disse resultater af oligotuftsinderivater kan have betydning for den proteolytiske nedbrydning af målpeptider, som kræver specifikke konformationelle forudsætninger. Copyright © 2007 European Peptide Society og John Wiley & Sons, Ltd.