Permakulttuurisuunnittelussa pyritään maksimoimaan siinä kasvavan ruoan tuotto. Edistämällä luonnon monimuotoisuutta, peräkkäisiä istutuksia, pinoamisjärjestelmiä ja tilankäytön tehokkuutta permakulttuurilohkon pitäisi pystyä tilan salliessa tuottamaan suuri osa puutarhurin tarvitsemista hedelmistä, vihanneksista ja yrteistä. Kunnioittamalla kasveja ja maaperää ja varmistamalla, että maaperässä on paljon orgaanista ainesta, jotta kasvit saavat kaikki tarvitsemansa ravinteet, puutarhuri viljelee vahvoja ja terveitä kasveja, jotka tuottavat suuren syötävän sadon.
Yksi houkuttelevimmista asioista oman ruoan kasvattamisessa on se, että voit siirtyä maasta ruokapöytään minimaalisessa ajassa, mikä takaa, että hedelmäsi ja vihanneksesi ovat tuoreimmillaan ja ravinteikkaimmillaan. Joskus tuottava kasvimaasi tuottaa kuitenkin enemmän satoa kuin voit syödä tuoreena.
Tämän runsauden ei pidä vain jättää kuihtumaan oksalle tai mätänemään maahan. On olemassa useita vaihtoehtoja, joita permakulttuurin harjoittaja voi käyttää ylimääräisen ruoan hyödyntämiseksi.
Se voi tarjota mahdollisuuden vaihtaa tietoja muiden paikallisten ruoanviljelijöiden kanssa. Usein, erityisesti kaupunkialueilla, joissa tontit ovat yleensä pienempiä, naapurit kasvattavat erilaisia vihanneksia ja hedelmiä. Vaihtamalla kukin voi hyödyntää runsaita satojaan ja lisätä ruokavalionsa valikoimaa. Hyvä sato voi myös antaa puutarhurille keinon ansaita tuloja myymällä esimerkiksi viljelijätoreilla.
Vaihtoehtona on kuitenkin myös se, että hedelmät ja vihannekset, joita ei syödä sadonkorjuun aikaan, säilötään paikan päällä. Näin voit paitsi pitää näitä elintarvikkeita saatavilla silloinkin, kun niillä ei ole sesonkiaikaa, myös kokeilla erilaisia tapoja käsitellä ja syödä tuotteitasi. Seuraavassa on lueteltu hedelmien ja vihannesten pääasialliset säilöntämenetelmät.
Säilöntä
Säilöntämenetelmässä hedelmät ja vihannekset sijoitetaan ilmatiiviisiin astioihin, yleensä lasipurkkeihin, ja näin estetään bakteerien pääsy niihin. Säilöttyä tavaraa voidaan tarvittaessa säilyttää hyllyssä vuosia. On olemassa kaksi menetelmää, joista toinen vaatii erikoiskoneen, joten se ei välttämättä ole käytännöllinen tai kustannustehokas monille ihmisille. Tämä on painesäilykemenetelmä, jonka avulla saavutetaan kiehumispistettä korkeampi lämpötila, jota vähähappoiset elintarvikkeet vaativat, jotta botulismibakteerien aktiivisuuden uhka voidaan tehokkaasti neutraloida. Menetelmään tarvitaan painesäilykinkone, ja sitä käytetään useimpien vihannesten säilöntämenetelmänä, koska niiden happopitoisuus on alhainen. Hedelmiä, joiden happopitoisuus on korkea, ei uhkaa botulismi, joten ne voidaan säilöä yksinkertaisemmalla menetelmällä. Laita hedelmät purkkiin, täytä ne kiehuvalla vedellä, jätä purkin yläreunaan noin tuuman verran tilaa (jotta hedelmät pääsevät laajenemaan), aja lastalla sisäreunan ympäri poistaaksesi mahdolliset ilmakuplat ja sulje sitten kierrekannella.
Käytitpä mitä tahansa menetelmää, purkit on steriloitava ennen täyttämistä. Tämä voidaan tehdä joko käyttämällä sterilointitabletteja, jollaisia käytetään vauvojen tuttipulloissa, tai laittamalla purkit (ja niiden kannet) uuniin alhaiselle lämpötilalle noin puoleksi tunniksi, jotta kaikki bakteerit kuolevat.
Suolaus
Suolausta, joka on yksi vanhimmista ruoan säilöntämenetelmistä, voidaan käyttää lihan ja kalan sekä viipaloitujen vihannesten säilöntään. Menetelmiä on kaksi. Ensimmäisessä käytetään pientä suolan ja vihannesten suhdetta (kahdesta viiteen prosenttia suolaa vihannesten painoa kohti). Tämä suolaustaso edistää maitohappobakteerien kasvua, mikä puolestaan estää muiden sellaisten bakteerimuotojen kasvua, jotka voisivat pilata ruoan. Se myös suolaa vihanneksia hieman. Toisessa menetelmässä käytetään suurempaa suolaprosenttia (20-25 prosenttia), jolloin vihannesten tuoreus säilyy, mutta ne maistuvat käytettäessä suolaisilta myös sen jälkeen, kun suola on pesty pois. Riippumatta siitä, mitä suolausmenetelmää käytät, tuotteet on säilytettävä jääkaapissa.
Kuivaus
Kuivaus kuivattaa hedelmät tai vihannekset, jolloin kaikki vesi sekä kosteudessa elävät bakteerit, hiivat ja homeet poistuvat. Sen lisäksi, että kuivaus muuttaa ruoan rakennetta, se muuttaa myös makua, tyypillisesti tiivistämällä sitä. Kuivattujen elintarvikkeiden lisäetuna on, että niitä on turvallista säilyttää sellaisenaan ruokakomeron hyllyllä – et tarvitse erityisiä pakkauksia niiden säilyttämiseen tai säilyttämiseen jääkaapissa. Joissakin maissa ruoan kuivaaminen auringossa on osa elämää, ja jos asut alueella, jossa aurinko paistaa tasaisesti, voit ehkä kuivata ruokaa tällä tavoin. Todennäköisempää on kuitenkin kuivaus uunissa. Tekniikka edellyttää matalaa lämpötilaa ja hyvää ilmankiertoa, joten käytä alhaisinta asetusta ja pidä uunin luukku auki – näin kosteuden haihtunut ilma pääsee poistumaan.
Pakastaminen
Jäädyttäminen
Jäädyttämällä hedelmiä ja vihanneksia pian niiden poimimisen jälkeen voidaan ”lukita” tuotteiden maku ja tuoreus. Pakastaminen ja sen jälkeen 
vihannesten tai hedelmien sulattaminen on säilöntämenetelmä, jolla saadaan lopputuote, joka muistuttaa eniten tuoreen ruoan makua. Pakastettaessa ruoka on käytännössä lepotilassa, joten pakasta aina kypsiä tuotteita ja vältä pilaantuneita yksilöitä. Voit pakastaa tuotteet vahalla päällystetyissä pahvipakkauksissa, muovirasioissa tai erittäin paksusta lasista valmistetuissa purkeissa. Pakastettavia vihanneksia on suositeltavaa valkaista kiehuvassa vedessä noin minuutti ennen pakastamista – tämä rajoittaa sellaisten entsyymien toimintaa, jotka voivat pilata tuotteet, jos niitä säilytetään pitkään. Tehokkaaseen pitkäaikaissäilytykseen tarvitaan jäätymispisteen alapuolella oleva lämpötila, joten käytä jääkaapin pakastinlokeroa elintarvikkeille, jotka aiot käyttää kuukauden kuluessa, sillä siellä lämpötila laskee harvoin vaadittuun nollaan asteeseen. Kun sulatat elintarvikkeita, jätä ne huoneenlämpöön, kunnes ne ovat täysin sulaneet, äläkä yritä sulattaa niitä uunissa.