Afrikkalainen kääpiöhiiri on hyvin pieni jyrsijä, joka ei kasva koskaan yli 15 senttimetriä suuremmaksi ja jonka keskimääräinen elinikä on kaksi vuotta. Niillä on vaalea vatsa ja niiden turkki on tyypillisesti punainen, mutta voi olla myös sininen. Sen maantieteellinen levinneisyysalue ulottuu Keski-Afrikasta aina itäiseen Afrikkaan ja aina Etelä-Afrikkaan ja Swazimaahan asti; afrikkalaiset kääpiöhiiripopulaatiot elävät monenlaisissa elinympäristöissä.
Ne ovat sosiaalinen laji, ja lemmikkieläiminä niitä suositellaan pidettäväksi pareittain tai mieluiten pienissä kolonioissa. Luonnossa ne elävät yksittäisten perheyksiköiden koloissa. Nämä rakennetaan roskakasojen tai kaatuneiden tukkien alle, ja kiviä kasataan niiden kolon eteen. Kiviin kertyy yön yli kastetta (vesipisaroita), jota hiiret juovat aamulla. Niillä on tuottelias lisääntymiskierto; kun ne ovat saavuttaneet lisääntymisikänsä (~6 viikkoa), ne voivat tuottaa yhden kuuden hiiren pentueen 20 päivän välein. Afrikkalaiset kääpiöhiiret syntyvät karvattomina ja sokeina, ja ne avaavat silmänsä kahden viikon kuluttua, ja ne vieroitetaan kuukauden kuluttua.
Useimmista nisäkkäistä poiketen suurin osa afrikkalaisista kääpiöhiiristä kantaa XY-kromosomiparia XX:n sijasta. Lisäksi on vielä naaraspuolisia afrikkalaisia kääpiöhiiriä, joilla on XX-kromosomit. Niiden X-kromosomeja koskevat tutkimukset osoittavat, että XY-naaraiden X-kromosomi on erilainen kuin XX-naaraiden ja XY-urosten X-kromosomi. On ennustettu, että XY-naaraiden X-kromosomissa on tuntematon mutaatio(t), joka estää niitä kehittymästä uroksiksi.