Amygdala-kompleksi on pitkään tunnettu osana tunteiden kannalta kriittistä hermopiiriä. Sen emotionaaliseen reaktiivisuuteen liittyvän roolin lisäksi tutkimukset eläinmalleilla ja potilailla, joilla on amygdala-vaurio, osoittavat sen merkityksen emotionaalisessa oppimisessa, jolloin vihjeet saavat merkityksensä assosioimalla ne palkitseviin tai vastenmielisiin tapahtumiin. Vaikka amygdalan toiminta assosiatiivisessa oppimisessa on vakiintunut, muut viimeaikaiset tutkimukset ovat edistäneet käsitystä, jonka mukaan amygdala säätelee muita kognitiivisia prosesseja, kuten muistia tai tarkkaavaisuutta. Esimerkiksi amygdalan toiminnan vastaavuus on äskettäin osoitettu muistin moduloinnissa ihmisillä ja koe-eläimillä. Eläinmallien käyttö on vähitellen määritellyt näiden toimintojen piirit amygdalassa ja sen yhteydet muihin aivojärjestelmiin, mukaan lukien reitit, joiden kautta amygdala moduloi muistia ja säätelee huomiota. Nämä eri tutkimuslinjat edistävät asteittain ymmärrystämme amygdalan roolista affektien ja kognition välisten yhteyksien luomisessa.