Tänään Bosnia ja Hertsegovina on valtio, joka koostuu kahdesta entiteetistä – Bosnian ja Hertsegovinan federaatiosta (FB&H) ja Serbitasavallasta (RS) – sekä yhdestä piirikunnasta – Brckon alueesta. Entiteeteillä on huomattavat valtuudet ja vastuu niiden kehittämisestä. Bosnia ja Hertsegovinan tasolla eli valtiotasolla on ministerineuvosto, jossa on kuusi ministeriötä, sekä muutama valtion asiantuntijalaitos, kuten tilastovirasto, standardointi-, mittaus- ja patentti-instituutti, televiestintävirasto jne.
Ympäristöalalla Bosnia ja Hertsegovinan ulkomaankauppa- ja taloussuhteiden ministeriö (MOFTER) vastaa toiminnan koordinoinnista ja kansainvälisistä suhteista.
Daytonin rauhansopimuksen jälkeen B&H:n ympäristöasiat ovat olleet entiteettien hallitusten vastuulla. Vastaavat viranomaiset ovat Bosnia ja Hertsegovinan federaation ympäristö- ja matkailuministeriö, Srpskan tasavallan fyysisen suunnittelun, rakennustekniikan ja ekologian ministeriö ja Brckon piirin yleishyödyllisten palvelujen osasto. Molempien entiteettien ministeriöiden ja Brckon piirin osaston toimintaa ohjaa ympäristölainsäädäntö.