Trypsiini pilkkoo spesifisesti peptidisidoksia lysiini- ja arginiinijäämien C-terminaalipuolella, lukuun ottamatta -Arg-Pro- ja -Lys-Pro-sidoksia, jotka normaalisti kestävät proteolyysin. Tässä raportoimme todisteita -Lys-Pro- tryptisestä pilkkoutumisesta muunnetuissa oligotuftsiinijohdannaisissa, Ac-4-NH2) (1), käyttäen korkean resoluution massaspektrometriaa ja HPLC:tä ensisijaisina menetelminä proteolyyttisten reaktioiden analysoimiseksi. -Lys-Pro-sidosten proteolyyttinen herkkyys riippui voimakkaasti niitä reunustavista jäännöksistä, ja peptidirungon joustavuus saattaa olla edellytys tälle epätavalliselle pilkkoutumiselle. Vaikka -Lys-Gly-sidokset 1:ssä pilkkoutuivat nopeasti, näiden Lys-jäännösten modifiointi kiinnittämällä ß-amyloidi(4-10)-epitooppi -Lys(X)-Gly-johdannaisiksi esti tämän sidoksen pilkkoutumisen ja mahdollisti -Lys-Pro-sidosten pilkkoutumisen trypsiinillä, ja tämän hajoamisreitti oli riippumaton Lys-Nε-sivuketjujen tyypistä (asetyyliryhmä, aminohappo, peptidi). Lys-jäännösten korvaaminen Ala:lla P′2-asemissa vähensi trypsiinin pilkkoutumista, kun taas Thr:n suurikokoisen sivuketjun korvaaminen P2-asemissa lisäsi voimakkaasti -Lys-Pro- sidosten pilkkoutumista. Muokattujen oligotuftsiinijohdannaisten sirkulaaridikroismi (CD) -tiedot ovat sopusoinnussa sen kanssa, että peptidirungon joustavuus on lisääntynyt, mikä on edellytyksenä sille, että -Lys-Pro-sidosten pilkkoutuminen lisääntyy. Näillä oligotuftsiinijohdannaisista saaduilla tuloksilla voi olla merkitystä sellaisten kohdepeptidien proteolyyttisen hajottamisen kannalta, jotka edellyttävät erityisiä konformaatioedellytyksiä. Copyright © 2007 European Peptide Society ja John Wiley & Sons, Ltd.
.