Meer Marion is ontstaan door de bouw van de Santee Dam in november 1941, als onderdeel van het hydro-elektrische en navigatieproject van het staatsbedrijf voor elektriciteit en water Santee Cooper. Het project omvatte ook de bouw van de Pinopolis Dam (Cooper River Dam) om het Moultrie Meer te creëren, onmiddellijk stroomafwaarts, en een afleidingskanaal van zeven en een halve mijl lang om de twee te verbinden. Dit was een van de infrastructuurprojecten die president Franklin D. Roosevelt tijdens de Grote Depressie steunde om werkgelegenheid te scheppen en in de toekomst te investeren.
De dam bij Wilson’s Landing is acht mijl lang en heeft 62 Tainter-gates. Ondanks zijn omvang genereert de Santee Dam slechts 1,92 megawatt waterkracht. De waterkrachtcentrales bij Pinopolis Dam waren ontworpen om het leeuwendeel van de energie te produceren volgens het oorspronkelijke plan: de dam genereert ongeveer 128 megawatt. In 1985 installeerde het United States Army Corps of Engineers, als onderdeel van een grootschalige omleiding en herontwerp, de waterkrachtcentrale St. Stephen Dam om de verloren gegane opwekkingscapaciteit van nog eens 84 megawatt terug te winnen.
Meer Marion wordt gevoed door vele zijrivieren, waaronder Wyboo Creek en de Santee River, en ook door talrijke bronnen, waaronder Eutaw Springs. Het meer is genoemd naar de Amerikaanse revolutionaire oorlogsgeneraal Francis Marion, legendarisch bekend als de “moerasvos”. Zijn voormalige huis in Pond Bluff was een van de ondergelopen gebieden toen het meer werd aangelegd.