Afrykańska mysz pigmejska jest bardzo małym gryzoniem, nigdy nie rośnie większa niż pięć cali, a jej średnia długość życia wynosi dwa lata. Mają blady brzuch i ich płaszcze są zwykle czerwone, ale mogą być również niebieskie. Jego zasięg geograficzny rozciąga się od Afryki Środkowej aż do Afryki Wschodniej i w dół do Afryki Południowej i Suazi; populacje afrykańskich myszy pigmejskich będą żyły w różnych siedliskach.
Jest to gatunek społeczny i jako zwierzęta domowe zaleca się trzymanie ich w parach, a najlepiej w małych koloniach. W naturze, będą one żyć w norach poszczególnych jednostek rodzinnych. Będą one zbudowane pod stosami gruzu lub upadłych kłód, układając kamyki przed ich norą. Przez noc na kamykach gromadzi się rosa (krople wody), którą myszy piją rano. Mają płodny cykl rozrodczy; po osiągnięciu wieku rozrodczego ~6 tygodni, mogą produkować miot składający się z jednej-sześciu myszy co 20 dni. Afrykańskie myszy pigmejskie rodzą się bezwłose i ślepe, otwierają oczy po dwóch tygodniach, a odstawione od piersi po miesiącu.
W przeciwieństwie do większości ssaków, większość samic afrykańskich myszy pigmejskich nosi parę chromosomów XY, a nie XX. Ponadto, istnieją jeszcze samice afrykańskich myszy pigmejów, które niosą XX chromosomów. Badania ich chromosomów X wskazują, że chromosom X samic XY jest inny niż chromosom X u samic XX i samców XY. Przewidywano, że chromosom X samic XY zawiera nieznaną mutację (mutacje), która uniemożliwia im rozwój jako samcom.