Nie mylić z Double Merle, Cryptic Merle lub „Phantom Merle” jak są nazywane, są dziką kartą wśród miotów. W rzadkich przypadkach Kryptyczny Merle może urodzić się w miocie każdego rodzica z genem Merle. Kryptyczny Merle jest mutacją genu Merle i wygląda jak Tri czarny, lub Tri czerwony, ale może mieć nadmiar łat białych na ciele, i rozpryski merle.
Nazywane są Phantom Merle, ponieważ w niektórych przypadkach nie może być widoczne merle ubarwienie wykryte i może być mylone z Tri kolorowe Aussie. Inne Kryptyczny Merle mogą być łatwo zauważone przez nadmiar białego lub większe plamy Merle na płaszczu.
Kryptyczne ubarwienie Merle pochodzi z genu Merle zwanego SINE (Short Interspeed Nucleotide Element). To właśnie ten gen sprawia, że umaszczenie Merle jest tak wszechstronne i wyjątkowe. Długość genu SINE u psa decyduje o tym, jak małe lub duże będą ciemne plamki lub łaty na umaszczeniu Merle.
Jeśli Krypto Merle jest hodowany z innym Merle, będą one produkować zarówno szczenięta Tri, jak i Merle. Istnieje jednak 3% szans, że będą one produkować podwójne Merle i związane z tym ryzyko głuchoty i ślepoty, dlatego też krypto Merle są również odradzane do hodowli.
Dłuższy gen SINE jest u psa, tym więcej merle będzie widać. Natomiast im krótszy jest gen SINE u psa, tym merle będzie mniej widoczne, i zacznie przypominać bardziej Tri, jak widać na poniższych zdjęciach od lewej do prawej.