Dzisiaj Bośnia i Hercegowina jest państwem składającym się z dwóch podmiotów – Federacji Bośni i Hercegowiny (FB&H) i Republiki Serbskiej (RS), oraz jednego dystryktu – Dystryktu Brczko. Jednostki te mają znaczną władzę i odpowiedzialność za swój rozwój. Na poziomie Bośni i Hercegowiny, czyli na poziomie państwowym, funkcjonuje Rada Ministrów z sześcioma ministerstwami, a także kilka państwowych instytucji eksperckich, takich jak Agencja Statystyczna, Instytut Standaryzacji, Pomiarów i Patentów, Agencja Telekomunikacyjna itp.
W sektorze ochrony środowiska Ministerstwo Handlu Zagranicznego i Stosunków Gospodarczych Bośni i Hercegowiny (MOFTER) jest odpowiedzialne za koordynację działań i stosunki międzynarodowe.
Od czasu porozumienia pokojowego z Dayton kwestie ochrony środowiska w B&H znajdują się w gestii rządów jednostek terytorialnych. Odpowiednie organy to Ministerstwo Środowiska i Turystyki w Federacji Bośni i Hercegowiny, Ministerstwo Planowania Fizycznego, Inżynierii Lądowej i Ekologii w Republice Serbskiej oraz Wydział Usług Komunalnych w Dystrykcie Brczko. Praca obu ministerstw i Departamentu Dystryktu Brczko jest regulowana przez zestaw ustaw dotyczących ochrony środowiska.