Ubiquityna jest małym (8,6 kDa) białkiem regulatorowym, a ubikwitynacja jest ważną modyfikacją potranslacyjną, w której ubikwityny są przyłączane do białek substratowych. Proces ten obejmuje trzy główne etapy: aktywację, koniugację i ligację i wymaga trzech typów enzymów: enzymów aktywujących ubikwitynę (E1s), enzymów koniugujących ubikwitynę (E2s) i ligaz ubikwitynowych (E3s).
Rysunek 1. System proteasomu ubikwitynowego (Suresh B, et al., 2016).
System ubikwityna-proteasom pośredniczy w 80%-85% degradacji białek u eukariotów. Oprócz udziału w degradacji białek, ubikwitynacja jest zaangażowana w prawie wszystkie czynności życiowe, w tym regulację cyklu komórkowego, proliferację, apoptozę, różnicowanie, regulację transkrypcji, ekspresję genów, regulację transkrypcji, przekazywanie sygnałów, naprawę uszkodzeń, odporność zapalną. Ubikwitynacja jest związana z patogenezą chorób, takich jak nowotwory i choroby układu sercowo-naczyniowego. Dlatego też stała się nowym celem dla badań i rozwoju nowych leków.
Overview of Protein Ubiquitination Analysis
Creative Proteomics opracowała już profesjonalną platformę dla usług analizy ubikwityny-proteomiki, aby pomóc Ci rozwiązać problemy badawcze związane z identyfikacją i kwantyfikacją ubikwitynacji. Dzięki kompleksowym usługom analizy ubikwitynacji białek, w tym ekstrakcji białek, trawienia, wzbogacania peptydów, analizy LC-MS/MS, analizy danych i analizy bioinformatycznej, możemy szybko, dokładnie i wydajnie analizować zmiany różnych modyfikacji białek związanych z chorobami, aby zaspokoić potrzeby identyfikacji biomarkerów i badań przesiewowych celów lekowych.
Rysunek 2. Przebieg analizy ubikwitynacji białek.
Wymagania dotyczące próbek
Możemy przyjąć różnorodne próbki, w tym między innymi:
- Tkanki roślinne: korzenie, ksylem, łyko itp.
- Tkanki zwierzęce
- Mikroorganizmy
-
Płyny ustrojowe: ślina, płyn owodniowy, płyn mózgowo-rdzeniowy, surowica, mocz itp.
-
Ekstrakt białkowy. W celu zapewnienia poprawności wyników testu prosimy o informację o składnikach buforu, czy zawiera on tiomocznik, SDS, czy silne sole jonowe. Ponadto próbka nie powinna zawierać składników takich jak kwasy nukleinowe, lipidy i polisacharydy, które będą miały wpływ na efekt separacji.
Jeśli chcesz poznać specyficzne wymagania dotyczące próbek, skontaktuj się z nami.
Dostawa
- Szczegółowy raport, w tym procedury eksperymentu, parametry itp.
- Surowe dane i wyniki analizy danych (identyfikacja białek i mapowanie ubikwityny)
Nasze zalety
- Wysoka przepustowość: identyfikacja i kwantyfikacja do tysięcy białek jednocześnie
- Wysoka precyzja i dokładność: dokładna identyfikacja zmodyfikowanych peptydów i miejsc modyfikacji
- 100% pokrycia: Użyj 2-3 enzymów do trawienia białek, aby zapewnić pełne pokrycie
- Możliwość analizy białek ubikwitynowych o niskiej obfitości
- Najnowocześniejsze urządzenia: Triple TOF 5600, Q-Exactive, Orbitrap Fusion Tribrid
W firmie Creative Proteomics wielu doskonałych i doświadczonych ekspertów zoptymalizuje protokół eksperymentalny zgodnie z Twoimi wymaganiami i zagwarantuje wysokiej jakości wyniki ubikwitynacji białek. Creative Proteomics oferuje szeroki zakres technologii do badań ubikwityny, które umożliwiają ilościowe oznaczanie ilości białek i modyfikacji ubikwitynacji. Zachęcamy do kontaktu w celu omówienia Państwa specyficznych potrzeb.