Wirus zapalenia wątroby typu C (HCV) odpowiada za około 20% przypadków ostrego zapalenia wątroby, 70% przypadków przewlekłego zapalenia wątroby i 30% przypadków schyłkowej choroby wątroby w Stanach Zjednoczonych. Ostra infekcja ma okres inkubacji 7 tygodni (zakres, 4-20 tygodni) i tylko u jednej trzeciej pacjentów przebiega bezobjawowo i z zażółceniem. Poziom aminotransferaz w surowicy jest zazwyczaj ponad 10-krotnie podwyższony i w miarę ustępowania objawów i dolegliwości obniża się do wartości prawidłowych. Przeciwciała przeciwko HCV są zwykle, ale nie zawsze, obecne w momencie wystąpienia objawów. HCV RNA pojawia się w surowicy wcześnie podczas okresu inkubacji, zwiększa miano i osiąga szczyt w momencie wystąpienia objawów, a następnie zanika w ustępującej chorobie. Co ważne, u 85% pacjentów z ostrym zakażeniem HCV rozwija się zakażenie przewlekłe. U tych pacjentów HCV RNA jest nadal obecne i u około dwóch trzecich pacjentów aminotransferazy pozostają podwyższone w zakresie od 1,5- do 10-krotnego przekroczenia górnej granicy normy. Przebieg przewlekłego zapalenia wątroby typu C jest zmienny. Prawdopodobnie u mniej niż 20% pacjentów występują objawy i są one zwykle przerywane, niejasne i niespecyficzne, głównie w postaci złego samopoczucia i łatwego męczenia się. U niewielkiego odsetka pacjentów występują pozawątrobowe manifestacje zapalenia wątroby typu C, w tym krioglobulinemia i kłębuszkowe zapalenie nerek. Szacuje się, że u 20% do 30% pacjentów z przewlekłym zapaleniem wątroby typu C rozwija się marskość wątroby, ale proces ten jest na ogół powolny i podstępny. Gdy marskość wątroby już się rozwinie, objawy są bardziej powszechne i mogą pojawić się oznaki schyłkowej choroby wątroby w postaci żółtaczki, osłabienia, wyniszczenia i krwawienia z przewodu pokarmowego. Pacjenci z marskością wątroby są również narażeni na ryzyko rozwoju raka wątrobowokomórkowego. Tak więc ta ważna choroba wątroby ma różnorodne objawy, ale często przebiega podstępnie i może prowadzić do schyłkowej niewydolności wątroby pomimo obecności niewielu objawów i oznak choroby.