Alai

Trypsin cleaves specifically peptide bonds at the C-terminal side of lysine and arginine residues, excepto para as ligações -Arg-Pro- e -Lys-Pro- que são normalmente resistentes à proteólise. Aqui relatamos evidências para uma clivagem -Lys-Pro- tryptic em derivados de oligotuftsina modificados, Ac-4-NH2) (1), usando espectrometria de massa de alta resolução e HPLC como métodos primários para análise de reações proteolíticas. A susceptibilidade proteolítica das ligações – Lis-Pro- era fortemente dependente de resíduos de flanco, e a flexibilidade da espinha dorsal do peptídeo poderia ser um pré-requisito para esta clivagem incomum. Enquanto -Lys-Gly- bonds em 1 foram rapidamente clivadas, a modificação desses resíduos de Lys pela fixação de um epitópo ß-amilóide(4-10) para render -Lys(X)-Gly derivatives impediu a clivagem dessa ligação, e proporcionou a clivagem da tripsina de -Lys-Pro- bonds, sendo o caminho dessa degradação independente do tipo de cadeias Lys-Nε-side (grupo acetil, aminoácido, peptídeo). A substituição dos resíduos de Lys por Ala nas posições P′2 diminuiu a clivagem tryptic, enquanto que a substituição da cadeia lateral volumosa de Thr nas posições P2 aumentou fortemente a clivagem das ligações -Lys-Pro-. Os dados do dicroísmo circular (CD) dos derivados de oligotuftsina modificados estão de acordo com a maior flexibilidade da espinha dorsal do peptídeo, como pré-requisito para o aumento da suscetibilidade à clivagem das ligações -Lys-Pro-. Estes resultados obtidos dos derivados de oligotuftsina podem ter implicações para a degradação proteolítica dos peptídeos alvo que requerem condições prévias específicas de conformação. Copyright © 2007 European Peptide Society and John Wiley & Sons, Ltd.