Nu există nicio certitudine cu privire la cauza acestei afecțiuni, dar specia bacteriană Staphylococcus aureus are un rol central și poate fi detectată în leziunile celor mai mulți pacienți. Nu este clar dacă este prezent un alt proces în primul rând steril cu colonizare secundară cu Staphylococcus aureus sau dacă Staphylococcus aureus începe procesul prin provocarea unei reacții imune puternice. O altă posibilitate este că Staphylococcus aureus produce toxine care acționează ca superantigeni care activează direct celulele T peste domeniul variabil al receptorilor celulelor T. Cu toate acestea, Staphylococcus aureus poate fi găsit la aproape toți pacienții afectați de această afecțiune, în timp ce este detectat doar la 20-30% dintre persoanele neafectate.
Dacă Staphylococcus aureus nu se găsește întotdeauna la persoanele care suferă de foliculită decalvină, trebuie să fie prezenți și alți factori. Prin examinări în familii s-a constatat că există o legătură familială cu aparițiile, ceea ce duce la concluzia că există o predispoziție genetică pentru aceasta; de exemplu, pacienții cu foliculită decalvină ar putea avea o deschidere ereditară diferită a foliculului de păr care ar putea facilita găzduirea bacteriei. Din punct de vedere imunologic, o altă posibilitate este că proteina de fixare intercelulară deosebit de puternică ICAM-1 contribuie la inflamație prin efectul său puternic de atragere a celulelor albe din sânge, cum ar fi granulocitele și limfocitele.
.