Alai

La tripsina taglia specificamente i legami peptidici sul lato C-terminale dei residui di lisina e arginina, ad eccezione dei legami -Arg-Pro- e -Lys-Pro- che sono normalmente resistenti alla proteolisi. Qui riportiamo la prova di una scissione triptica -Lys-Pro- in derivati oligotuftsin modificati, Ac-4-NH2) (1), utilizzando la spettrometria di massa ad alta risoluzione e HPLC come metodi primari per l’analisi delle reazioni proteolitiche. La suscettibilità proteolitica dei legami -Lys-Pro- era fortemente dipendente dai residui di accompagnamento, e la flessibilità della spina dorsale peptidica potrebbe essere un prerequisito per questa insolita scissione. Mentre i legami -Lys-Gly- in 1 sono stati rapidamente scissi, la modifica di questi residui Lys mediante l’attaccamento di un epitopo ß-amiloide(4-10) per produrre derivati -Lys(X)-Gly ha impedito la scissione di questo legame, e ha fornito la scissione della tripsina dei legami -Lys-Pro-, il percorso di questa degradazione essendo indipendente dal tipo di catene Lys-Nε-side (gruppo acetilico, aminoacido, peptide). La sostituzione dei residui Lys con Ala nelle posizioni P′2 ha diminuito la scissione trittica, mentre la sostituzione della catena laterale ingombrante di Thr nelle posizioni P2 ha fortemente aumentato la scissione dei legami -Lys-Pro-. I dati di dicroismo circolare (CD) dei derivati oligotuftsin modificati sono in accordo con una maggiore flessibilità della spina dorsale del peptide, come prerequisito per una maggiore suscettibilità alla scissione dei legami -Lys-Pro-. Questi risultati ottenuti dai derivati dell’oligotuftsina potrebbero avere implicazioni per la degradazione proteolitica dei peptidi target che richiedono specifiche precondizioni conformazionali. Copyright © 2007 European Peptide Society e John Wiley & Sons, Ltd.