Il lago Marion fu creato dalla costruzione della diga di Santee nel novembre 1941, parte del progetto idroelettrico e di navigazione del Santee Cooper, di proprietà statale. Il progetto includeva anche la costruzione della diga di Pinopolis (diga del fiume Cooper) per creare il lago Moultrie, immediatamente a valle, e un canale di deviazione lungo sette miglia e mezzo per collegare i due. Questo fu uno dei progetti di infrastrutture sostenuti dal presidente Franklin D. Roosevelt durante la Grande Depressione per fornire posti di lavoro e investire nel futuro.
La diga di Wilson’s Landing è lunga otto miglia e ha 62 porte Tainter. Nonostante le sue dimensioni, la diga di Santee genera solo 1,92 megawatt di energia idroelettrica. Gli impianti idroelettrici della diga di Pinopolis sono stati progettati per produrre la parte del leone dell’energia secondo lo schema originale: genera circa 128 megawatt. Nel 1985, come parte di una rediversione e riprogettazione su larga scala, il Corpo degli Ingegneri dell’Esercito degli Stati Uniti ha installato l’impianto idroelettrico di St. Stephen Dam per recuperare la capacità di generazione persa di altri 84 megawatt.
Il lago Marion è alimentato da molti affluenti, tra cui Wyboo Creek e il fiume Santee, e anche da numerose sorgenti, tra cui Eutaw Springs. Il lago prende il nome dal generale della guerra rivoluzionaria americana Francis Marion, conosciuto leggendariamente come “Swamp Fox”. La sua ex casa di Pond Bluff fu una di quelle inondate quando il lago fu creato.