L’ubiquitina è una piccola (8,6 kDa) proteina regolatrice e l’ubiquitinazione è un’importante modifica post-traslazionale, in cui le ubiquitine sono attaccate a una proteina substrato. Questo processo contiene tre fasi principali: attivazione, coniugazione e legatura e richiede tre tipi di enzimi: enzimi attivatori dell’ubiquitina (E1s), enzimi coniugatori dell’ubiquitina (E2s) e ligasi dell’ubiquitina (E3s).
Figura 1. Il sistema dell’ubiquitina proteasoma (Suresh B, et al., 2016).
Il sistema ubiquitina-proteasoma media l’80%-85% della degradazione delle proteine negli eucarioti. Oltre a partecipare alla degradazione delle proteine, l’ubiquitinazione è coinvolta in quasi tutte le attività della vita, compresa la regolazione del ciclo cellulare, la proliferazione, l’apoptosi, il differenziamento, la regolazione trascrizionale, l’espressione genica, la regolazione trascrizionale, la trasmissione del segnale, la riparazione dei danni, l’immunità infiammatoria. L’ubiquitinazione è legata alla patogenesi delle malattie, come il cancro e le malattie cardiovascolari. Pertanto, è diventato un nuovo obiettivo per la ricerca e lo sviluppo di nuovi farmaci.
Panoramica dell’analisi dell’ubiquitinazione delle proteine
Creative Proteomics ha già sviluppato una piattaforma professionale per i servizi di analisi dell’ubiquitina-proteomica per aiutarvi ad affrontare i problemi di ricerca di identificazione e quantificazione dell’ubiquitinazione. Attraverso servizi completi di analisi dell’ubiquitinazione delle proteine, tra cui l’estrazione delle proteine, la digestione, l’arricchimento dei peptidi, l’analisi LC-MS/MS, l’analisi dei dati e l’analisi bioinformatica, possiamo analizzare in modo rapido, accurato ed efficiente i cambiamenti di varie modifiche proteiche legate alle malattie per soddisfare le esigenze di identificazione dei biomarcatori e lo screening dei target dei farmaci.
Figura 2. Il flusso di lavoro dell’analisi dell’ubiquitinazione delle proteine.
Requisiti del campione
Possiamo accettare una varietà di campioni, inclusi ma non limitati a:
- Tessuti vegetali: radici, xilema, floema, ecc.
- Tessuti animali
- Microorganismi
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Fluidi corporei: saliva, liquido amniotico, liquido cerebrospinale, siero, urina ecc.
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Estratto di proteine. Al fine di garantire i risultati del test, si prega di informare i componenti del buffer, se contiene tiourea, SDS, o sali di ioni forti. Inoltre, il campione non dovrebbe contenere componenti come acidi nucleici, lipidi e polisaccaridi, che influenzerà l’effetto di separazione.
Se si desidera conoscere i requisiti specifici dei campioni, non esitate a contattarci.
Consegna
- Rapporto dettagliato, comprese le procedure di esperimento, parametri, ecc
- Risultati grezzi e analisi dei dati (identificazioni delle proteine e mappatura dell’ubiquitina)
I nostri vantaggi
- High-throughput: identificare e quantificare fino a migliaia di proteine contemporaneamente
- Alta precisione e accuratezza: identificazione accurata di peptidi modificati e siti di modifica
- 100% di copertura: Utilizzo di 2-3 enzimi per la digestione delle proteine per garantire una copertura completa
- Capacità di analizzare proteine ubiquitine a bassa abbondanza
- Strutture all’avanguardia: Triple TOF 5600, Q-Exactive, Orbitrap Fusion Tribrid
A Creative Proteomics, molti esperti eccellenti ed esperti ottimizzeranno il protocollo sperimentale secondo le tue esigenze e garantiranno risultati di alta qualità per l’ubiquitinazione delle proteine. Creative Proteomics fornisce una vasta gamma di tecnologie per la ricerca sull’ubiquitina che consentono di quantificare la quantità di proteine e la modifica dell’ubiquitinazione. Non esitate a contattarci per discutere le vostre esigenze specifiche.