Ubiquitin är ett litet (8,6 kDa) reglerande protein och ubiquitinering är en viktig posttranslationell modifiering där ubiquitiner fästs vid ett substratprotein. Denna process innehåller tre huvudsteg: aktivering, konjugering och ligering och kräver tre typer av enzymer: ubiquitinaktiverande enzymer (E1s), ubiquitinkonjugerande enzymer (E2s) och ubiquitinligaser (E3s).
Figur 1. Ubiquitinproteasomsystemet (Suresh B, et al., 2016).
Ubiquitin-proteasomsystemet medierar 80-85 % av proteinnedbrytningen i eukaryoter. Förutom att delta i proteinnedbrytning är ubiquitinering involverad i nästan alla livsaktiviteter, inklusive cellcykelreglering, proliferation, apoptos, differentiering, transkriptionsreglering, genuttryck, transkriptionsreglering, signalöverföring, skadereparation, inflammatorisk immunitet. Ubiquitering är relaterad till patogenesen av sjukdomar, t.ex. cancer och kardiovaskulära sjukdomar. Därför har det blivit ett nytt mål för forskning och utveckling av nya läkemedel.
Översikt över analys av ubiquitinering av proteiner
Creative Proteomics har redan utvecklat en professionell plattform för ubiquitin-proteomik-analystjänster för att hjälpa dig att ta itu med forskningsproblem med identifiering och kvantifiering av ubiquitinering. Genom omfattande analystjänster för ubiquitinering av proteiner, inklusive proteinextraktion, digestion, peptidanrikning, LC-MS/MS-analys, dataanalys och bioinformatikanalys, kan vi snabbt, noggrant och effektivt analysera förändringarna av olika sjukdomsrelaterade proteinmodifieringar för att tillgodose behoven av identifiering av biomarkörer och screening av läkemedelsmål.
Figur 2. Arbetsflödet för analys av ubiquitinering av proteiner.
Provkrav
Vi kan ta emot en mängd olika prover, inklusive men inte begränsat till:
- Plantvävnader: rötter, xylem, floem osv.
- Djurvävnader
- Mikroorganismer
-
Kroppsvätska: saliv, fostervatten, cerebrospinalvätska, serum, urin etc.
-
Proteinextrakt. För att säkerställa testresultaten, vänligen informera om buffertkomponenterna, om de innehåller tiourea, SDS eller starka jonsalter. Dessutom bör provet inte innehålla komponenter som nukleinsyror, lipider och polysackarider, vilket kommer att påverka separationseffekten.
Om du vill veta specifika krav på prover är du välkommen att kontakta oss.
Leverans
- Detaljerad rapport, inklusive experimentprocedurer, parametrar osv.
- Rådata och dataanalysresultat (proteinidentifieringar och ubiquitinkartläggning)
Våra fördelar
- Hög genomströmning: Identifiera och kvantifiera upp till tusentals proteiner på en gång
- Hög precision och noggrannhet: Noggrann identifiering av modifierade peptider och modifieringsställen
- 100% täckning: Använd 2-3 enzymer för proteindeslutningen för att säkerställa full täckning
- Förmåga att analysera ubiquitinproteiner med låg abundans
- Stadsnabba anläggningar: Triple TOF 5600, Q-Exactive, Orbitrap Fusion Tribrid
På Creative Proteomics kommer många utmärkta och erfarna experter att optimera experimentprotokollet enligt dina krav och garantera högkvalitativa resultat för ubiquitinering av protein. Creative Proteomics tillhandahåller ett brett utbud av tekniker för ubiquitinforskning som möjliggör kvantifiering av proteinmängd och ubiquitineringsmodifiering. Kontakta gärna oss för att diskutera dina specifika behov.