I dag är Bosnien och Hercegovina en stat som består av två entiteter – Bosnien och Hercegovinas federation (FB&H) och Republika Srpska (RS), och ett distrikt – Brckodistriktet. Enheterna har betydande befogenheter och ansvar för sin egen utveckling. På Bosnien och Hercegovinas nivå, dvs. på statlig nivå, finns ministerrådet med sex ministerier samt ett par statliga expertinstitutioner, t.ex. byrån för statistik, institutet för standardisering, mätningar och patent, byrån för telekommunikation osv.
I miljösektorn har Bosnien och Hercegovinas ministerium för utrikeshandel och ekonomiska förbindelser (MOFTER) ansvar för samordning av verksamhet och internationella förbindelser.
Sedan Dayton-fredsavtalet har miljöfrågorna i B&H legat under entitetsregeringarnas ansvar. Motsvarande myndigheter är ministeriet för miljö och turism i Federationen Bosnien och Hercegovina, ministeriet för fysisk planering, civilingenjörskonst och ekologi i Republiken Srpska och avdelningen för försörjningstjänster i Brckodistriktet. Arbetet i både entitetsministerierna och avdelningen i Brcko-distriktet styrs av en uppsättning miljölagar.