Stephen VI (eller VII), (född i Rom – död juli/augusti 897 i Rom), påve från maj 896 till augusti 897.
Den tid då han valdes till påve Bonifatius VI:s efterträdare var söndersliten av fraktioner som leddes av romerska aristokrater och av härskare i Neapel, Benevento, Toscana och Spoleto (till vars härskarfamilj Stefan var medlem). Guy, hertig av Spoleto, hade motvilligt krönts (891) till helig romersk kejsare av påven Stefan V (VI), och Guys son Lambert hade krönts till medkejsare av påven Formosus. Båda dessa föregående påvar hade föredragit den östfrankiske kungen Arnulf, och 896 övergav Formosus spoletanerna och krönte Arnulf till helig romersk kejsare, vilket utlöste en stormig konflikt mellan de stridande fraktionerna. Efter Bonifatius’ två veckors pontifikat valdes Stefan, som då var biskop i Anagni, till påve, och det spoletanska partiet fick kontroll över Rom.
Stephen var en partisan av Lambert, som förmådde honom att genomföra en av de gräsligaste händelserna i den påvliga historien – den ”kadaversynoden” (eller Synodus Horrenda). Spolitanerna var så drivna av hat mot Formosus att de åstadkom ett koncilium utan motstycke (897) vid vilket Formosus lik grävdes upp och ställdes inför rätta. Bland anklagelserna mot Formosus var att han okanoniskt hade övergått från biskopssätet i Porto till biskopssätet i Rom (enligt gällande kyrkolagstiftning var det förbjudet för en biskop att övergå från ett säte till ett annat). Det verkliga syftet med rättegången var dock att blidka och tillfredsställa politisk fiendskap; spolitanerna anklagade Formosus för att i egenskap av ledare för den rivaliserande fraktionen ha krönt en oäkta ättling till Karl den store efter att han redan hade krönt Lambert. Det var oundvikligt att Stefans parti strävade efter att förstöra Formosos fraktion.
Stephen beordrade att det nio månader gamla kadaveret skulle klädas om i påvliga kläder och ställas upp i den påvliga tronen. Han fortsatte sedan med att ogiltigförklara Formosus pontifikat och förklara hans handlingar (inklusive de heliga ordnar som han hade tilldelat) ogiltiga. Eftersom Formosus hade utsett Stefan till biskop i Anagni befriade annulleringen Stefan från anklagelser om oegentligheter i samband med hans överföring från sätet i Anagni till Rom.
Stephen avslutade rättegången genom att beordra att liket skulle släpas genom gatorna och dumpas i floden Tibern.
Efter några månader avsatte ett uppror Stephen från sitt ämbete. Han berövades sina påvliga insignier, fängslades och ströps, men hans parti hittade en annan ledare i den mordlystne påven Sergius III. Tolv år av blod, intriger och terror följde.