Yleisesti ottaen useimmat lääkärit käyttävät vastasyntyneen Marfanin oireyhtymää kuvaamaan lapsia, joilla on syntymähetkellä silmiinpistäviä ulkoisia piirteitä sekä merkittävä sydän- ja verisuonijärjestelmän (sydämen) vaurioituminen hyvin varhaisessa lapsuudessa.
Erityisen voimakkaita piirteitä ovat usein pitkät raajat ja sormet, nivelten löysyys ja kontraktuurat, tyypillinen kasvonpiirre, jossa silmät ovat syvälle asettuneet ja alaspäin vinoutuneet ja/tai korvat rypistyneet, löysä ja ylimääräinen iho, huono ravitsemus, hengitysvaikeudet, sarveiskalvon suurentuminen tai glaukooma sekä vakava mitraaliläpän ja/tai kolmiliuskaläpän läpän läpi tapahtuva prolapsi ja vuoto, joka voi johtaa sydänlihaksen huonoon puristukseen (sydämen vajaatoiminta).
Muita Marfanin oireyhtymän lievemmille muodoille tyypillisiä löydöksiä voi myös esiintyä, kuten pectus deformiteetti (sisäänvedetty tai ulkoneva rintakehä), skolioosi (kaareva selkä), likinäköisyys, aortan juuren laajentuma (laajentuma) ja silmän linssin siirtymä.
Neonataalinen Marfanin oireyhtymä on spektrin pahin ääripää, ja jopa neonataalisten Marfan-potilaiden sisällä vaikeusaste vaihtelee riippuen piirteiden yhdistelmästä ja yksittäisten osatekijöiden vaikeusasteesta.
Neonataalinen Marfanin oireyhtymä on eri kokonaisuus kuin Marfanin oireyhtymä. Sillä on varhain alkavia ja nopeasti eteneviä piirteitä, jotka liittyvät vakavimmin sydämeen, keuhkoihin ja hengitysteihin.
Monet lääkärit käyttävät vastasyntyneen Marfanin oireyhtymää kuvaamaan Marfanin oireyhtymän kliinisen spektrin vakavaa ääripäätä sen sijaan, että pitäisivät sitä erillisenä kliinisenä kokonaisuutena. Olisi varottava käyttämästä tätä nimitystä pelkästään siksi, että lapsella diagnosoidaan Marfanin oireyhtymä varhaislapsuudessa, sillä tämä saattaa liittyä vain varhaiseen arviointiin, joka johtuu perheessä esiintyvästä Marfanin oireyhtymästä tai erityisen tarkkasilmäisestä lastenlääkäristä, eikä siihen, että kyseessä olisi epätyypillisen vakava taudin vaikeusaste.