オトギリソウの仲間は、樹木、低木、一年草、多年草と、その習性は実に多様です。 ほとんどの木本類は一つの基部から複数の茎を出すので、単茎の木本類という意味での樹木はまれである。 低木は茎が直立したり広がったりするが、地面に接する節から発根することはない。 しかし、多年生草本類は、特に湿潤な場所に生息するものは、この水平方向の節から発根する傾向がある。 一年草は、二次的な毛根が発達したタップルーツ（根）を持つことが多い。
Hypericumの特徴的な点状模様は2種類の腺、「暗色腺」と「淡色腺」で形成されています。 暗色腺は黒から赤みがかったはっきりした色の細胞の集まりからなる。 その色合いは、ナフトジアンスロン、ヒペリシンまたはシュードヒペリシン、あるいはその両方が存在することを示している。 これらの腺はオトギリソウの約3分の2の部位に存在し、通常、特定の器官に限定されている。 これらの腺をつぶすと、ナフトジアンスロンが赤い染みを作る。 16世紀、パラケルススはこの赤い分泌物を「ヨハネス・ブルート」と呼び、この植物を殉教者セント・ジョンと結びつけ、英語とドイツ語で「セント・ジョンズ・ワート」という一般名称を生んだ。 清澄な点を形成する淡い腺は、それぞれ扁平な細胞が並ぶ分裂性の細胞内空間で、油分やヒペルフォリンなどのフロログルシノール誘導体を分泌する。 このヒペリシン腺の分布は、一般草食動物が植物を食べることを躊躇させる。 オトギリソウを一般的な昆虫が食べると、30-100%多くのナフトジアントロンを生成し、昆虫を忌避する。
茎に沿って組織が4つの薄い隆起があり、オトギリソウの対生十字形の葉と密接に関連している。 稜線は、単に「稜」と呼ばれる小さなものと、「翼」と呼ばれる目立つものがあります。 茎は、テレテ、2本線、6本線がまれに生じることがある。 樹木や低木に生育する種では、樹齢とともに節間はほとんどテリート状になるが、成熟した植物ではまだ線の痕跡が認められる。 線条数は重要な区別点であり、例えば、H. perforatumとHypericum maculatumは、H. perforatumが2本、H. maculatumが4本であることを除けば、容易に混同される。 茎に淡色腺と濃色腺がある種と，ない種がある。 オトギリソウ属の葉はほぼ全種が対生し、十字形に配列するが、例外的にコリディウム属では3〜4枚の葉が渦状に配列される。 葉には棘がなく、無柄か短い葉柄がありますが、AdenosepalumとHypericumでは長い葉柄があります。 基部に関節があり、関節より上は落葉する場合と、ない場合があり、その場合、葉は持続する。 Campylosporus節とBratys節では葉の基部が耳介のように反射する種があるが，真の耳介はDrosocarpium節，Thasia節，Crossophyllum節にのみ存在する。 層別脈理は非常に多様で，2分冊状から羽状，あるいは密な網目状である。 葉の形は卵形から細長いもの、線形が多い。 葉は、節間より短いのが普通です。
一般に萼片は4～5枚ですが、Myriandra属ではまれに3枚のものもあります。 5枚の萼片がある場合は五分円形で、4枚の場合は対生で十字形になる。 萼片は等しいものと不等なものがある。 ヒルテラ、テニオカルピウム、アルスロフィラムに見られるように、萼片は基部で一体となることがある。 縁は様々で、縁取り腺、歯、または毛がある。
Hypericumの花弁はほとんどすべて黄色ですが、薄いレモン色から濃いオレンジがかった黄色までさまざまな色が存在する。 例外として、オトギリソウの花弁が白またはピンク色を帯びているものがあります。 花弁に赤色が混じる種も多く、H. capitatum var. capitatumの深紅の花弁もその一例である。 花弁の長さは等しいものと不等なものがある。 花弁はアデノトリアスとエロデスのものを除いて、ほとんどが非対称である。 この2つの節では、雄しべの束の間に不妊体が発達し、宿根草として偽管状花の花弁を広げるという特殊な受粉機構を持つ。 ほぼ全種が花弁に腺を持つが、アデノトリアスの項だけが完全に腺を持つ。 花弁の赤色の強さは、腺に含まれるヒペリシンの含有量と相関しているという仮説があるが、スカイリン誘導体など他の色素でも赤色を作ることができる。
ヒペリカムの花には4～5個の束があり、合計5～200個の雄しべを持つ。 鞘翅目は自由であったり、様々な形で融合し、しばしば3つの鞘翅目となる。 Myriandra, Brathys, Trigynobrathysの一部では，雄しべは環状になる。 雄しべは通常持続するが、中には落葉するものもある。 雄しべの結合組織には葯があり、琥珀色から黒色までさまざまな色があります。
卵巣は3個または5個、時には2個で、それに対応する数の自由または結合した雄しべがあります。 種子は腋窩または頭頂の胎盤に着生し、胎盤1枚に少なくとも2個の子房がある。 オトギリソウの果実は、他のオトギリソウ科の植物とは異なり、莢状で先端から開裂する。 莢は乾燥したものと、成熟しても肉質が残っているものがある。 莢膜の表面には細長い腺や点状の腺があり、様々な形や模様を作っている。 これらの腺は一般に淡い琥珀色であるが、Drosocarpiumの項では赤黒い腺である。 ある種のこれらの腺を抽出すると、フロログルシノールとテルペノイド誘導体が得られ、これらの腺と植物組織の青白い腺との関連が示唆される。 オトギリソウの種子は小さく、色は黄褐色から濃い紫褐色の範囲である。 種子は円筒形から楕円形で、狭い翼を持つこともある。 種子の一部には基部隆起があり、まれにアデノトリアスの項では頂部稜があり、アリを誘引して種子を散布させることがある。 種によっては発芽条件や生存条件が非常に特殊なものもある。 例えば，H. lloydiiは湿度が高すぎると苗の段階で菌類に感染しやすくなるが，H. chapmaniiなど他の種は水中で成長することができる
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