W uzupełnieniu do fermentacji, istnieją inne sposoby wytwarzania aminokwasów, takie jak reakcja enzymatyczna, ekstrakcja i synteza.
W procesie reakcji enzymatycznej, jeden lub dwa rodzaje enzymów są używane do przekształcenia prekursora aminokwasów we właściwy aminokwas. W tej metodzie nie ma potrzeby namnażania mikroorganizmów poprzez przekształcanie konkretnego aminokwasu, nie ma też długiego procesu rozpoczynającego się od glukozy. Proces reakcji enzymatycznej jest idealny, jeśli substancja prekursorowa ma niski koszt.
Aminokwasy mogą być produkowane przez rozbicie białek, znane jako metoda ekstrakcji. Jednakże, ilość aminokwasów w białku źródłowym ogranicza ilość aminokwasów wykonanych. Ekstrakcja nie jest dobry do podejmowania masowych ilości konkretnych aminokwasów.
Synteza wykorzystuje reakcje chemiczne do produkcji aminokwasów, i był szeroko stosowany we wczesnym rozwoju sposobów wytwarzania aminokwasów. Problem z syntezy jest to, że reakcje chemiczne sprawiają, że równe ilości L- i D-aminokwasów. W rezultacie, D-aminokwasy, które są wykonane muszą być następnie wykonane w L-aminokwasów. Ta droższa metoda wymaga zatem dodatkowych etapów przetwarzania i urządzeń, dlatego też była stopniowo wycofywana z produkcji. Jednak nadal jest używany do produkcji glicyny, która nie występuje w formach D- i L-, a dla aminokwasów, gdzie nie ma różnicy, czy są one D- lub L- formy, gdy używany.
Zaletą fermentacji jest to, że pozwala nam produkować masowe ilości aminokwasów przy niskich kosztach, przy stosunkowo małych zakładach. Wykorzystanie fermentacji do produkcji aminokwasów pomogło w rozwoju rynku aminokwasów. W latach 60-tych produkcja glutaminianu przestawiła się z ekstrakcji na fermentację, a produkcja innych aminokwasów następowała po sobie.
.