Förutom fermentering finns det andra sätt att tillverka aminosyror, till exempel genom enzymatisk reaktion, extraktion och syntes.
I den enzymatiska reaktionsprocessen används en eller två typer av enzymer för att förvandla en aminosyreprekursor till rätt aminosyra. I denna metod finns det inget behov av att föröka mikroorganismer genom att omvandla den specifika aminosyran, och det finns ingen lång process som utgår från glukos. Den enzymatiska reaktionsprocessen är idealisk om prekursorsubstansen har en låg kostnad.
Aminosyror kan framställas genom att bryta ner proteiner, den så kallade extraktionsmetoden. Mängden aminosyror i källproteinet begränsar dock mängden aminosyror som tillverkas. Extraktion är inte bra för att göra massmängder av specifika aminosyror.
Syntes använder kemiska reaktioner för att göra aminosyror, och användes i stor utsträckning i den tidiga utvecklingen av sätt att göra aminosyror. Problemet med syntes är att kemiska reaktioner gör lika stora mängder L- och D-aminosyror. Därför måste de D-aminosyror som tillverkas sedan omvandlas till L-aminosyror. Denna dyrare metod kräver därför extra bearbetningssteg och utrustning och har därför gradvis fasats ut ur produktionen. Den används dock fortfarande för att framställa glycin, som inte förekommer i D- och L-form, och för aminosyror där det inte är någon skillnad om de är i D- eller L-form när de används.
Fördelen med jäsning är att den gör att vi kan framställa massmängder av aminosyror till en låg kostnad med relativt små anläggningar. Att använda fermentering för att framställa aminosyror har bidragit till att aminosyramarknaden har vuxit. På 1960-talet övergick tillverkningen av glutamat från extraktion till fermentering och tillverkningen av andra aminosyror följde efter varandra.